仔细审题发现忽略了“如果奖学金相同，输出出现最早的学生的姓名”这个条件。（错误的地方出现在第二个和倒数第二个）
更改了排序方法，解决，供参考。

#include <stdio.h>

typedef struct
{
    char name[20];    //姓名
    int final;    //期末成绩
    int asse;    //评定成绩
    char leader;
    char western;    //是否西部
    int paper;    //发表论文
    int salary;    //奖金
}student;


int salary(student p){    //计算奖金
    int average = p.final;
    int money = 0;

    if(average > 80 && p.paper >= 1)
        money = money + 8000;
    if(average > 85 && p.asse >80)
        money = money + 4000;
    if(average > 90)
        money = money + 2000;
    if(average > 85 && p.western =='Y')
        money = money + 1000;
    if(p.asse > 80 && p.leader == 'Y')
        money = money + 850;
    return money;
}


int main(int argc, char const *argv[])
{   
    //录入学生信息

    int N;    //学生总数
    scanf("%d",&N);
    student temp;
    student a[N];
    for (int i = 0; i < N; i++)    //输入信息
    {
        scanf("%s %d %d %c %c %d ",&a[i].name,&a[i].final,&a[i].asse,&a[i].leader,&a[i].western,&a[i].paper);
        a[i].salary = salary(a[i]);
    }
    
    //求最多奖学金的学生
    for(int i = 1;i < N;i++){
        if(a[i].salary > a[0].salary){
            temp = a[i];
            a[i] = a[0];
            a[0] = temp;
        }
    }
    printf("%s\n%d\n",a[0].name,a[0].salary);

    //输出总奖学金
    int all = 0;
    for (int i = 0; i < N; i++)
    {
        all = all + a[i].salary;
    }
    printf("%d\n",all );
    return 0;
}