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相似基因

相似基因

题目背景

大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了\(4\)种核苷酸,简记作\(A,C,G,T\)。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。

在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。

题目描述

两个基因的相似度的计算方法如下:

对于两个已知基因,例如\(AGTGATG\)和\(GTTAG\),将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基 \(-\),例如:

\(A\) \(G\) \(T\) \(G\) \(A\) \(T\) \(-\) \(G\)
\(-\) \(G\) \(T\) \(-\) \(-\) \(T\) \(A\) \(G\)

这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:

\(~\) \(A\) \(C\) \(G\) \(T\) \(-\)
\(A\) \(5\) \(-1\) \(-2\) \(-1\) \(-3\)
\(C\) \(-1\) \(5\) \(-3\) \(-2\) \(-4\)
\(G\) \(-2\) \(-3\) \(5\) \(-2\) \(-2\)
\(T\) \(-1\) \(-2\) \(-2\) \(5\) \(-1\)
\(-\) \(-3\) \(-4\) \(-2\) \(-1\) \(*\)

那么相似度就是:\((-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9\)。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:

\(A\) \(G\) \(T\) \(G\) \(A\) \(T\) \(G\)
\(-\) \(G\) \(T\) \(T\) \(A\) \(-\) \(G\)

相似度为:\((-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14\)。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。

格式

输入格式

共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含\(A,C,G,T\)四个字母。\(1 \le \)序列的长度\( \le 100\)。

输出格式

仅一行,即输入基因的相似度。

样例1

样例输入1

7 AGTGATG
5 GTTAG

样例输出1

14