相似基因
题目背景
大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了\(4\)种核苷酸,简记作\(A,C,G,T\)。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。
题目描述
两个基因的相似度的计算方法如下:
对于两个已知基因,例如\(AGTGATG\)和\(GTTAG\),将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基 \(-\),例如:
\(A\) | \(G\) | \(T\) | \(G\) | \(A\) | \(T\) | \(-\) | \(G\) |
---|---|---|---|---|---|---|---|
\(-\) | \(G\) | \(T\) | \(-\) | \(-\) | \(T\) | \(A\) | \(G\) |
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
\(~\) | \(A\) | \(C\) | \(G\) | \(T\) | \(-\) |
---|---|---|---|---|---|
\(A\) | \(5\) | \(-1\) | \(-2\) | \(-1\) | \(-3\) |
\(C\) | \(-1\) | \(5\) | \(-3\) | \(-2\) | \(-4\) |
\(G\) | \(-2\) | \(-3\) | \(5\) | \(-2\) | \(-2\) |
\(T\) | \(-1\) | \(-2\) | \(-2\) | \(5\) | \(-1\) |
\(-\) | \(-3\) | \(-4\) | \(-2\) | \(-1\) | \(*\) |
那么相似度就是:\((-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9\)。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
\(A\) | \(G\) | \(T\) | \(G\) | \(A\) | \(T\) | \(G\) |
---|---|---|---|---|---|---|
\(-\) | \(G\) | \(T\) | \(T\) | \(A\) | \(-\) | \(G\) |
相似度为:\((-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14\)。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。
格式
输入格式
共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含\(A,C,G,T\)四个字母。\(1 \le \)序列的长度\( \le 100\)。
输出格式
仅一行,即输入基因的相似度。
样例1
样例输入1
7 AGTGATG
5 GTTAG
样例输出1
14